Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX1P48742 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms