Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GPC1P35052 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GPC1P35052 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GPC1P35052 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms