Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIMD1P0DJR0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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