Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCATO75600 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCATO75600 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms