Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms