Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms