Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms