Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM161AQ9NX61 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM161AQ9NX61 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM161AQ9NX61 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM161AQ9NX61 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM161AQ9NX61 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM161AQ9NX61 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM161AQ9NX61 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM161AQ9NX61 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM161AQ9NX61 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms