Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms