Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC61Q9BV99 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms