Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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