Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RNF185Q96GF1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms