Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms