Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCSTNQ92542 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCSTNQ92542 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms