Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms