Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms