Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC84Q86UT8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms