Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTE2Q6XPS3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTE2Q6XPS3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms