Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3L3Q68CJ9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms