Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms