Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FAM187BQ17R55 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FAM187BQ17R55 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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