Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CYTH1Q15438 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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