Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms