Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SYCP1Q15431 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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