Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 RPS24-210ENST00000478655 727 ntTSL 1 (best)5.61□□□□□ -1.518e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.548e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 OSBPL10-209ENST00000467598 538 ntTSL 45.33□□□□□ -1.568e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.568e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.568e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RPS24-213ENST00000485708 544 ntTSL 25.31□□□□□ -1.568e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.598e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LINC01515-203ENST00000594054 1068 ntTSL 54.98□□□□□ -1.618e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RPS24-205ENST00000464716 452 ntTSL 24.93□□□□□ -1.628e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PRKAA1-207ENST00000509874 692 ntTSL 44.83□□□□□ -1.648e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LINC01515-213ENST00000601926 757 ntTSL 54.6□□□□□ -1.678e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LINC01515-212ENST00000601888 781 ntTSL 54.56□□□□□ -1.688e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.748e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LARP4-215ENST00000550260 583 ntTSL 33.87□□□□□ -1.791e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LINC01515-210ENST00000600848 748 ntTSL 53.81□□□□□ -1.88e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PHACTR4-208ENST00000633167 553 ntTSL 53.77□□□□□ -1.818e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZHX1-204ENST00000517516 780 ntTSL 33.73□□□□□ -1.818e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LINC01515-205ENST00000595737 573 ntTSL 52.93□□□□□ -1.948e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.132e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.422e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 GTF3C3-205ENST00000448087 1702 ntTSL 25.96□□□□□ -1.452e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-209ENST00000554947 1203 ntTSL 223.1■■□□□ 1.297e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.887e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-216ENST00000556175 775 ntTSL 319.98■□□□□ 0.797e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-203ENST00000544691 1507 ntTSL 1 (best)18.41■□□□□ 0.547e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-218ENST00000556262 1960 ntTSL 218.28■□□□□ 0.527e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-220ENST00000556548 2336 ntTSL 217.98■□□□□ 0.477e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.197e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.177e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.017e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-215ENST00000555830 418 ntTSL 314.77□□□□□ -0.057e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SDR39U1-207ENST00000553937 217 ntTSL 38.45□□□□□ -1.067e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.227e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NCOA7-210ENST00000453302 581 ntTSL 311.58□□□□□ -0.567e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NCOA7-204ENST00000417494 765 ntTSL 210.34□□□□□ -0.757e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NCOA7-206ENST00000428318 548 ntTSL 39.29□□□□□ -0.927e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NCOA7-205ENST00000419660 488 ntTSL 58.45□□□□□ -1.067e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NCOA7-211ENST00000487635 758 ntTSL 1 (best)7.08□□□□□ -1.287e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.477e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.577e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-12■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.196e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.36e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 AL355312.2-202ENST00000628047 876 ntTSL 54.96□□□□□ -1.622e-12■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.151e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.281e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 314.17□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ANP32A-209ENST00000495764 504 ntTSL 513.66□□□□□ -0.221e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ARRB1-208ENST00000531012 1744 ntTSL 214.78□□□□□ -0.046e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ARRB1-209ENST00000532447 701 ntTSL 510.49□□□□□ -0.736e-9■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 FRAS1-202ENST00000502446 2217 ntTSL 512.53□□□□□ -0.48e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 FRAS1-203ENST00000508900 2169 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.428e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.298e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.148e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.238e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.919e-8■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.823e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 REV1-203ENST00000413697 4727 ntTSL 218.86■□□□□ 0.613e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 FITM2-201ENST00000396825 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-15■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LDLR-201ENST00000252444 5337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.281e-8■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 LDLR-214ENST00000560628 535 ntTSL 39.46□□□□□ -0.91e-8■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CERS2-202ENST00000345896 2170 ntTSL 228.93■■■□□ 2.222e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.932e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.692e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 ACTN1-209ENST00000553659 434 ntTSL 415.4■□□□□ 0.065e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 ACTN1-221ENST00000556571 568 ntTSL 410.92□□□□□ -0.665e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 ACTN1-208ENST00000553370 605 ntTSL 39.06□□□□□ -0.965e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 ILF3-218ENST00000590009 953 ntTSL 513.21□□□□□ -0.295e-18■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.244e-7■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.065e-9■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.085e-9■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CASP2-204ENST00000472067 5769 ntTSL 29.57□□□□□ -0.885e-9■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 SLC1A5-206ENST00000598022 276 ntTSL 313.17□□□□□ -0.31e-9■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 TMED10-205ENST00000556969 1314 ntTSL 26.56□□□□□ -1.366e-20■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.171e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.141e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CERK-202ENST00000443629 1760 ntTSL 1 (best)20.92■□□□□ 0.942e-8■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-8■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.36e-11■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.26e-11■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.055e-8■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-12■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.87■□□□□ 0.131e-12■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.011e-12■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.011e-12■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 TEAD4-206ENST00000540314 578 ntTSL 416.22■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 TEAD4-205ENST00000536826 570 ntTSL 416.14■□□□□ 0.172e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.299e-7■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 ATP6V0B-208ENST00000473485 1664 ntTSL 222.04■■□□□ 1.122e-10■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)21.76■■□□□ 1.072e-10■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.772e-10■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.582e-10■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-10■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-10■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.365e-10■■□□□ 13.6
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