Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms