Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK18Q07002 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms