Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABPB1Q06547 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms