Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms