Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRX1P78414 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRX1P78414 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRX1P78414 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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