Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms