Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms