Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ME1P48163 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ME1P48163 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms