Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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GDF5P43026 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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GDF5P43026 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GDF5P43026 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GDF5P43026 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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