Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP8P40818 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP8P40818 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP8P40818 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP8P40818 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP8P40818 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP8P40818 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP8P40818 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP8P40818 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP8P40818 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP8P40818 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP8P40818 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP8P40818 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms