Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms