Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFTRP13569 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFTRP13569 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms