Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms