Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPINC1P01008 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms