Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRATO95237 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRATO95237 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRATO95237 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRATO95237 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRATO95237 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRATO95237 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRATO95237 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRATO95237 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms