Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPP2O95045 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UPP2O95045 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UPP2O95045 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UPP2O95045 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UPP2O95045 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UPP2O95045 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UPP2O95045 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms