Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKAP2O75563 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms