Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1GO43497 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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