Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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