Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MCRIP1C9JLW8 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms