Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVV-2B6SEH9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms