Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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