Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NOTOA8MTQ0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms