Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ9

GNPTG, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTGQ9UJJ9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNPTGQ9UJJ9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms