Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms